แคปซูลเคลือบลำไส้ใช้ในการรักษาโรคติดเชื้อในลำไส้ การเคลือบลำไส้ของแคปซูลเหล่านี้ป้องกันไม่ให้ละลายในสภาพแวดล้อมที่เป็นกรดของกระเพาะอาหารและช่วยให้เนื้อหาผ่านลำไส้ไปยังจุดที่เหมาะสมที่สามารถทำงานเพื่อรักษาโรคได้ อย่างไรก็ตาม อาจระคายเคืองต่อกระเพาะอาหารอย่างมากหากใช้ไม่ถูกต้อง
ข้อได้เปรียบหลักของแคปซูลเคลือบลำไส้คือความสามารถในการรักษาอาการระคายเคืองในทางเดินอาหาร แคปซูลเหล่านี้สามารถมีสารต่อต้านไบโอติกและส่วนผสมที่ออกฤทธิ์ทางชีวภาพอื่นๆ ที่ต่อสู้กับการติดเชื้อและการระคายเคือง ข้อดีอีกประการของแคปซูลเคลือบลำไส้คือมีความชื้นน้อยที่สุด ซึ่งเป็นตัวเลือกที่ดีสำหรับสูตรดูดความชื้นหรือสูตรที่ไวต่อความชื้น
ประโยชน์อีกประการของแคปซูลเคลือบลำไส้คือไม่ละลายในปาก ทำให้มั่นใจได้ว่าสารออกฤทธิ์จะไปถึงจุดเป้าหมาย ซึ่งจะช่วยป้องกันไม่ให้แคปซูลย่อยสลายในกระเพาะอาหารและช่วยป้องกันไม่ให้ยาปนเปื้อน
